igraph-help
[Top][All Lists]
Advanced

[Date Prev][Date Next][Thread Prev][Thread Next][Date Index][Thread Index]

[igraph] Reading Python-generated graph files with R


From: ivogt
Subject: [igraph] Reading Python-generated graph files with R
Date: Tue, 13 Jan 2009 15:10:01 +0100
User-agent: Thunderbird 2.0.0.14 (X11/20080501)

Hi everybody,
I have problems with reading graph-files with R previously generated with Python igraph module via write().

> g = read.graph('test.ml',type='GraphML')
Error in read.graph.edgelist(file, ...) :
  At foreign.c:95 : parsing edgelist file failed, Parse error

I get this error message also with the Pajek file format.

The graph is weighted and directedand initialised as follows:

g = graph(edges=arc_list,directed=True,vertex_attrs={'Name':target_IDs},edge_attrs={'Weight':arc_attrs})

Basic analysis and plotting with python works, but as the python documentation is quite sparse with regard to examples, and as I have read that the functionality is lacking some features present under R, I have decided to write the graph to a file and proceed under R.

Thanks a lot,
Ingo


--------
Abans d'imprimir aquest missatge, si us plau, comprova que és realment
necessari. El medi ambient és cosa de tots.

Antes de imprimir este mensaje, por favor, comprueba que es realmente
necesario. El medio ambiente es cosa de todos.

Before printing this e-mail, please make certain it is absolutely necessary.
The environment is everybody's business.
--------

La informació continguda en aquest missatge i en qualsevol fitxer adjunt és confidencial, privada i d'ús exclusiu per al destinatari. Si no és la persona a la qual anava dirigida aquesta informació, si us plau, notifiqui immediatament l'enviament erroni al remitent i esborri el missatge. Qualsevol còpia, divulgació, distribució o utilització no autoritzada d'aquest correu electrònic i dels seus adjunts està prohibida en virtut de la legislació vigent.

La información contenida en este mensaje y en cualquier fichero adjunto es confidencial, privada y de uso exclusivo para el destinatario. Si usted no es la persona a la cual iba dirigida esta información, por favor, notifique inmediatamente el envío erróneo al remitente y borre el mensaje. Cualquier copia, divulgación, distribución o utilización no autorizada de este correo electrónico y de sus adjuntos está prohibida en virtud de la legislación vigente.

The information included in this e-mail and any attached files is confidential and private. If you are not the intended recipient, please notify the sender and delete this message immediately. Dissemination, forwarding or copying of this e-mail and its associated attachments is strictly prohibited in accordance with current legislation.
--------

Attachment: ivogt.vcf
Description: Vcard


reply via email to

[Prev in Thread] Current Thread [Next in Thread]